學習技能發育障礙可能由多種因素引起，包括腦結構側化異常、睪酮水平異常、文字系統解決過程中的異常、識字模式或語言通路異常、世界觀方式或空間痛覺障礙，以及內耳前庭功能內分泌失調等。此外，父母和家庭的負面生活事件也可能加劇此類問題。